Araştırma Çıktıları | WoS | Scopus | TR-Dizin | PubMed
Permanent URI for this communityhttps://hdl.handle.net/20.500.14719/1741
Browse
773 results
Search Results
Publication Metadata only Combined ligand and structure-based virtual screening approaches for identification of novel AChE inhibitors(2020) Kader Sahin; Serdar Durdagi; BAHÇEŞEHİR ÜNİVERSİTESİ; BAHÇEŞEHİR ÜNİVERSİTESİThe excessive activity of acetylcholinesterase enzyme (AChE) causes different neuronal problems, especiallydementia and neuronal cell deaths. Food and Drug Administration (FDA) approved drugs donepezil, rivastigmine,tacrine and galantamine are AChE inhibitors and in the treatment of Alzheimer’s disease (AD) these drugs are currentlyprescribed. However, these inhibitors have various adverse side effects. Therefore, there is a great need for the novelselective AChE inhibitors with fewer adverse side effects for the effective treatment. In this study, combined ligand-basedand structure-based virtual screening approaches were used to identify new hit compounds from small molecules libraryof National Cancer Institute (NCI) containing approximately 265,000 small molecules. In the present study, we developeda computational pipeline method to predict the binding affinities of the studied compounds at the specific target sites.For this purpose, a text mining study was carried out initially and compounds containing the keyword “indol” wereconsidered. The therapeutic activity values against AD were screened using the binary quantitative structure activityrelationship (QSAR) models. We then performed docking, molecular dynamics (MD) simulations and free energy analysisto clarify the interactions between selected ligands and enzyme. Thus, in this study we identified new promising hitcompounds from a large database that may be used to inhibit the enzyme activity of AChE.Publication Open Access Duvarın Dili: Bizans Kenti Ayasoluk’un Erken Rönesans Dönemi Floransa’sına Yansımaları(2020) Çağaptay, Suna; Bahçeşehir Üniversitesi1300’lü yılların başında Floransa’da Santa Croce Kilisesi bünyesinde masrafları kentin yerlisi önemli aileler tarafından karşılanarak inşa edilen şapellerin dekoratif programı pek çok çalışmada incelenmiştir. Bu makale ise, Santa Croce içinde Peruzzi ailesi tarafından inşa edilen Peruzzi Şapel’inde Giotto tarafından yapılan Aziz Yuhanna ve Vaftizci Yahya’nın hayatından sahneler sunan panelleri kısaca tanıtıp ardından mikro bir analiz önererek Drusiana’nın diriltilmesi anlatısına odaklanır. Olay, İncil yazarı Aziz Yuhanna’ya atfedilen ve Yuhanna'nın Eylemleri olarak bilinen, Yeni Ahit’e eklenmiş bir yan metinde bahsedilen bir mucizedir ve Bizans dönemi Anadolu’sunun en önemli kutsal kentleri arasında sayılan, ve adını Aziz Yuhanna’dan alan, Ayasoluk kentinde gerçekleşmiştir. Yazı kapsamında, şapelin dekoratif programı genel çerçevesiyle incelendikten sonra, Giotto’nun Aziz Yuhanna’ya atfedilen bu mucizevi eylemi nasıl resme döktüğü, hangi mimari ip uçları sayesinde Ayasoluk kurgusunu yarattığı ve bu görsel kurgunun taşıdığı anlamlar tartışılacaktır. Ayrıca, Geç Orta Çağ veya Erken Rönesans dönemi resim sanatında kent imgesinin vurgulanmasında kent kapıları, surlar, ve dinî yapılar ve diğer mimari detayların Giotto tarafından nasıl kullanıldığı Roland Barthes’ın “gerçeklik etkisi” teorisi bağlamında incelenecektir. Ayrıca, Giotto’nun 14. yüzyıl Floransa’sında Ayasoluk’un kentsel dokusunu canlandırması girişiminin Peruzzi ailesinin siyasi, ekonomik ve kültürel gücünün yansıtma aracı olarak kullanması dinamiği de metinde irdelenmektedir.Publication Open Access ACİL SERVİS PERSONELİNE GÖRE ŞİDDETİN NEDENLERİ(2020) Aydoğan, Ahmet; Üçlü, Rabia; Aydemir, İshak; Bahçeşehir Üniversitesi; İstanbul Üniversitesi - Cerrahpaşa; Üsküdar ÜniversitesiAmaç: Bu çalışmada acil serviste çalışan sağlık personelinin uğradığışiddet türleri ve şiddetin nedenleri ele alınmıştır. Temelamaç, şiddetin nedenleri ve türlerini ortaya koymak ve bu konudaalınması gereken koruyucu ve önleyici tedbirler konusundafarkındalığı arttırmaktır.Gereç ve Yöntem: Bu araştırma betimsel tarama modelini esasalan bir çalışmadır. Bu araştırmanın çalışma grubu, İstanbul ÜniversitesiCerrahpaşa, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Dekanlığına bağlıhastanenin acil servisinde çalışan tüm sağlık personeli (Doktor,hemşire, acil tıp teknisyenleri, gibi sağlık hizmetleri sınıfı, idarihizmetler olan güvenlik, bilgi işlem gibi)’nden oluşmaktadır. Acilserviste çalışan 121 sağlık personeli çalışmaya katılmayı kabuletmiştir.Bulgular: Araştırmada elde edilen sonuçlara göre, sağlık personelineşiddet uygulayanlar sıralamasında %64 oran ile hasta yakınlarıilk sırada, %33,3 oran ile hastalar ikinci sırada yer almıştır.Acil serviste şiddet en fazla 24:00–08:00 saatleri arasındaki vardiyada(%40) uygulanmakta, personelin %52,1 daha önce şiddetemaruz kalmış, kaldıkları şiddet türü sıralamasında %52 ile sözelşiddet ilk sırada, fiziksel şiddet ikinci sırada, duygusal şiddetüçüncü sırada ve son sırada ise cinsel taciz yer almaktadır.Sonuç: Acil servis personeline göre, acil servislerde şiddetinortaya çıkmasında en etkili nedenler, hastaların sabırsız olması,hasta ve sağlık çalışanları arasında etkili iletişim kurulamaması,bekleme sürelerinin uzun olması ve personel sayısının eksiliği enönemli faktörler olarak karşımıza çıkmaktadır.Publication Open Access Functional Reorganization in the Primary Somatosensory Cortex of Rat Following Hind-Paw Amputation: A Study of Functional Imaging with 1.5 Tesla MRI(2020) Arslanhan, Ayça; Şirinoğlu, Hakan; Güngör, Abuzer; Ekşi, Murat Şakir; Özcan Ekşi, Emel Ece; Erbil, Sertaç; Algın, Oktay; Konya, Deniz; Marmara Üniversitesi; T.C. Sağlık Bakanlığı; Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi; Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi; Bahçeşehir Üniversitesi; Marmara Üniversitesi; Ankara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi; Bahçeşehir ÜniversitesiAIM: To learn how rat primary somatosensory cortex (pSSC) responses to the loss of inputs from hind-paw, using fMRI of an inferiormagnetic power (1.5 Tesla) with special designed high-powered rat coil.MATERIAL and METHODS: Ten adult male Sprague-Dawley rats were enrolled in this study. The rats were anesthetized withketamine injection. Xylazine was intraperitoneally injected for analgesia and muscle relaxation with careful maintenance ofspontaneous respiration. Either right or left hind-paws were amputated under aseptic conditions according to predefined randomallocation of the rats. A 12-channel rat surface coil developed for proper image resolution in 1.5 Tesla MR was used. Functionalmagnetic resonance imaging was obtained before hind-paw amputation, 2, 15 and 30 days after the amputation.RESULTS: Activation signals were detected in 5 rats’ contralateral pSSC before the hind-paw amputation with regression andcessation of the signal after the amputation. Signal re-appeared in the contralateral pSSC of only one rat (rat 9) 30 days after theamputation.CONCLUSION: This study showed that functional plasticity might occur in the pSSC following hind-paw amputation of rats.Further studies are necessary to understand the true nature of the plasticity observed in pSSC, with new and novel measurementtechniques on cellular basis rather than gross anatomical one.Publication Open Access Multicenter study of levodopa carbidopa intestinal gel in Parkinson’s disease: the Turkish experience(2020) Bilgiç, Başar; Murat Gültekin; Erer Özbek, Çiğdem Sevda; Tezcan, Sabiha; Mirza, Meral; Yılmaz Kuşbeci, Özge; Çakmur, Raif; Akbostancı, Muhittin Cenk; Günal, Dilek; Hanağası, Haşmet Ayhan; Elibol, Bülent; Bora Tokcaer, Ayşe; Kenangil, Gülay; Doğu, Okan; Ulukan, Çağrı; İstanbul Üniversitesi; Erciyes Üniversitesi; Bursa Uludağ Üniversitesi; Ankara Üniversitesi; Erciyes Üniversitesi; T.C. Sağlık Bakanlığı; Dokuz Eylül Üniversitesi; Ankara Üniversitesi; Marmara Üniversitesi; İstanbul Üniversitesi; Hacettepe Üniversitesi; Gazi Üniversitesi; Bahçeşehir Üniversitesi; Mersin Üniversitesi; Ankara ÜniversitesiBackground/aim: Our purpose was to determine the efficacy of levodopa carbidopa intestinal gel (LCIG) in a series of Turkish patientswith Parkinson’s disease (PD).Materials and methods: We had telephone calls with 54 patients from 11 neurology centers who were on LCIG treatment, and 44patients or their caregivers were included in an eight-item survey between September 2015 and June 2016. The reliability and validity ofthe survey were evaluated with intraclass correlation coefficients for every question separately.Results: Average age of the patients were 63.48 and the duration of PD was 12.79 years. Average LCIG treatment period was 15.63months. Percentages of the patients who reported they were ‘better’ after LCIG treatment were as follows: 80% for time spent off, 55% fordyskinesia, 65% for tremor, 85% for gait disorder, 50% for pain, 50% for sleep disorders, 42.5% for depression, 32.5% for incontinence,and 70% for activities of daily living. Cronbach’s alpha was 0.795 and the intraclass correlation coefficient was reliable for the items.Conclusion: As detected by a survey performed by telephone calls with good interrater reliability, patients with PD improve with LCIGtreatment in many aspects of the disease.Publication Open Access Örgütsel Sinizmin Örgütsel Bağlılık Üzerine Etkisinin İncelenmesi: Hekimlere Yönelik Bir Araştırma(2020) Koçoğlu Sazkaya, Merve; Terzi, Cansu; Marmara Üniversitesi; Bahçeşehir ÜniversitesiBu araştırmanın literatür bölümünde örgütsel sinizm ve örgütsel bağlılık kavramları, boyutları ve sonuçları konularıele alınmıştır. Örgütsel sinizmin örgütsel bağlılık üzerine etkisini incelemek amacıyla yapılan bu çalışma İstanbul’dakamu ve özel hastanelerde çalışan 436 doktor üzerinde gerçekleştirilmiştir. Araştırma sonucuna göre hekimlerinörgütsel sinizm algılarının örgütsel bağlılık üzerinde negatif yönlü etkisi olduğu belirlenmiştir. Bu etkinin alt boyutlarıincelendiğinde de örgütsel sinizmin örgütsel bağlılığın alt boyutları olan duygusal bağlılık, devamlılık bağlılığı venormatif bağlılık üzerinde negatif yönlü etkisi olduğu tespit edilmiştir.Publication Open Access Ratlarda Deneysel Spinal Kord Hasar Modelinde Genisteinin Nöroprotektif Etkisinin Araştırılması, Diffüz Tensor Görüntüleme ile Değerlendirilmesi(2020) İncir, Said; Silav, Gökalp; Öztürk, Gülşah; Arslanhan, Ayça; Akçetin, Mustafa Ali; Toktaş, Zafer Orkun; Konya, Deniz; Koç Üniversitesi; İstanbul Gelişim Üniversitesi; İstanbul Gelişim Üniversitesi; Ankara Üniversitesi; Sağlık Bilimleri Üniversitesi; Bahçeşehir Üniversitesi; Bahçeşehir ÜniversitesiAmaç: Spinal kord hasarı (SKH), insidansı çok yüksek olmamasına rağmen, bu durumun sonuçları birey, aile ve toplum için son derece önemli sekellerle sonuçlanabilecek bir hastalıktır. Nöral hasar onarımı ile ilgili her geçen gün yeni çalışmalar umut vadetmekle birlikte SKH için kür olabilecek altın standart bir tedavi henüz yoktur. Bu çalışmada ratlarda ağırlık düşürme modeli kullanılarak oluşturulan spinal kord hasarı sonrası tedavi amaçlı verilen, bir tirozinkinaz inhibitörü olan Genistein (GEN) isimli fitoöstrojenin etkisi araştırılmış ve geç dönemde sayılı rat üzerindeki diffüzyon tensör görüntüleme (DTG) ile sonuçları değerlendirilmiştir. Yöntem: Çalışma Marmara Üniversitesi Başıbüyük Nörolojik Bilimler Enstitüsü’nde yapıldı. Çalışmada toplam 28 adet 200-250 gr ağırlığında Sprague-Dawley sıçan randomize olarak 4 eşit gruba bölündü: Grup 1 (n=7 sıçan) kontrol grubu (sadece laminektomi uygulanan), Grup 2 (n=7 sıçan) travma grubu, Grup 3 (n=7 sıçan) travma + dimetil sülfoksid (DMSO) uygulanmış grup, Grup 4 (n=7 sıçan) travma+DMSO+GEN (0,25 mg /kg/rat GEN) uygulanmış grup. Genistein DMSO aracılığıyla çözülebilen bir maddedir. Grup 1’e sadece T10-12 laminektomi uygulandı. Grup 2, 3 ve 4’e T10-12 total laminektomi sonrası ağırlık düşürme modeli kullanılarak spinal kord travması yapıldı. Grup 4’e 7 gün boyunca 0,25 mg/kg/rat GEN uygulandı. Grup 1’den bir, diğer gruplardan 3’er adet toplam 10 adet randomize seçilen ratın spinal kordu postoperatif 28. günde Diffüzyon tensör görüntüleme ile değerlendirildi. Alınan doku örnekleri Hematoksilen-Eosin (HE), Kristal Viole ve Luksol Fast Blue (LFB) ile boyanıp ışık mikroskobunda incelendi. Çalışmada kullanılan tüm ratlar postoperatif 6. saat, 24. saat, 7., 14., 21. ve 28. günlerde lökomotor derelecelendirme skalası (BBB) kullanılarak değerlendirildi. Bulgular: GEN grubunda, diğer travma gruplarına göre fonksiyonel iyileşme puanları daha iyi olmasına rağmen tüm travma grupları arasında anlamlı istatistiksel fark gözlenmemiştir (p>0.05). Travmadan 28 gün sonra alınan görüntü örneklerinde, travma uygulanan gruplarda, lezyon merkezinde fraksiyonel anizotropi (FA) değerlerinin azaldığı gözlenmiştir. Sonuç: Spinal kord travmasında GEN etkinliği, GEN uygulanmış travma grubunda, diğer travma gruplarıyla karşılaştırıldığında nörolojik iyileşmede BBB motor skala sonuçlarına göre artış göstermiş olup istatistiksel olarak anlamlı sonuç elde edilmemiştir. Çalışma, spinal kord travmasında GEN kullanımı için temel bir bilgi düzeyi oluşturmuş olup daha geniş kapsamlı bir çalışmada doz bağımlı araştırma yapılabilir. Yardımcı tanısal araç olarak kullanılan DTG’nin travma sonrası takipte önemli rol alabileceği öngörülmüştür.Publication Open Access Assessment of Spatiotemporal Gait Parameters in Patients with Lumbar Disc Herniation and Patients with Chronic Mechanical Low Back Pain(2020) Amir Rashedi Bonab, Masoud; Kuru Çolak, Tuğba; Toktaş, Zafer Orkun; Konya, Deniz; Marmara Üniversitesi; Marmara Üniversitesi; Bahçeşehir Üniversitesi; Bahçeşehir ÜniversitesiAIM: To assess spatiotemporal gait parameters in patients with lumbar disc herniation (LDH) and chronic mechanical low back pain(CMLBP), and compare with healthy control group.MATERIAL and METHODS: A total of 70 patients was enrolled in this prospective, controlled cross-sectional study, of which 25with LDH, 25 with CMLBP and 20 healthy individuals as the control group. Participants completed 10 passes on the “WIN-TRACK”Gait Analysis Platform at their self-selected walking speed. The arithmetic mean of the five flawless walking data was used foranalysis. Pain intensity is assessed by the Visual Analog Scale (VAS).RESULTS: The spatiotemporal gait parameters were significantly decreased in LDH and CMLBP groups than the healthy controlgroup, particularly in LDH groups (p≥0.001). It was found that pain intensity is negatively correlated to step and stride length,cadence and velocity (p<0.001). Results of linear regression analysis showed that 10% of the changes in gait cycle duration of theleft extremity and 74% of the changes in the velocity were associated with pain intensity.CONCLUSION: Pain intensity can affect the spatiotemporal gait parameters in patients with Low Back Pain (LBP). Rehabilitationprograms with gait optimization should be considered in the management of patients with LDH and CMLBP.Publication Open Access The effects of resveratrol treatment on caveolin-3 expression and $Na^+$ /$K^+$ ATPase activity in rats with isoproterenol-induced myocardial injury(2020) Özkan, Naziye; Akkiprik, Mustafa; Çetinel, Şule; Tetik, Şermin; Yiğiner, Ömer; Acar, Zehra; Aykaç, Aslı; Şehirli, Ahmet Özer; Çağlayan Yeğen, Berrak; Şener, Göksel; Tezcan, Mehmet; Marmara Üniversitesi; Marmara Üniversitesi; Marmara Üniversitesi; Marmara Üniversitesi; Bahçeşehir Üniversitesi; Marmara Üniversitesi; Yakın Doğu Üniversitesi; Yakın Doğu Üniversitesi; T.C. Sağlık Bakanlığı; Marmara Üniversitesi; T.C. Sağlık BakanlığıOBJECTIVE: The present study aims to investigate the therapeutic effects of resveratrol (RES) on isoproterenol (ISO) induced myocardial injury rat model.METHODS: Catecholamine-induced heart damage was induced by ISO treatment for 30 days. The rats were divided intofour groups as follows: the control group received saline, the ISO group received 5.0 mg/kg ISO, the RES group received 10mg/kg RES, and the ISO-RES group received 10 mg/kg RES and 5 mg/kg ISO treatments for 30 days. Following echocardiographic measurements and body weight recorded, the rats were decapitated. Plasma and cardiac tissue samples obtained bydecapitation were analyzed using biochemical, histopathological, molecular and immunohistochemical methods.RESULTS: In the ISO group, Na+/K+ ATPase activity and ATP content, GSH, and caveolin-3 levels were low. LDH, CK and lysosomal enzyme activities, MDA level, and MPO activity were found to be high. It was determined that GSH and MDA levels and MPO,Na+/K+ ATPase activity, ATP content caveolin-3 levels changes that arose from ISO treatment were suppressed by RES treatment.CONCLUSION: RES treatment has ameliorated all the functional and biochemical parameters. The results obtained in thisstudy suggest that RES is a promising supplement against catecholamine exposure as it improves antioxidant defense mechanisms in the heart. In the light of above-mentioned data, RES can be assumed as a promising agent in ameliorating theoxidative injury of the myocardium.Publication Open Access Correlation of Renal Colic Incidences with the Season, Gender and Age: Cross-Sectional Study(2020) Güner, Doğu; Ürkmez, Ahmet; Yüksel, Özgür Haki; Akan, Serkan; Yıldırım, Çağlar; Şahin, Aytaç; T.C. Sağlık Bakanlığı; Sağlık Bilimleri Üniversitesi; Bahçeşehir Üniversitesi; T.C. Sağlık Bakanlığı; T.C. Sağlık Bakanlığı; T.C. Sağlık BakanlığıIntroduction: In the present study, we researched whether meteorological changes affect the number of renal colic patientsadmitted to the hospital emergency department and whether this effect varies with gender and age.Methods: In this study, 5661 patients admitted to the emergency medicine clinic of Fatih Sultan Mehmet Training andResearch Hospital between the dates of January 2017 and December 2017 with renal colic complaints were retrospectivelyscanned with International Classification for Diseases- 10 (ICD 10) N23 (renal colic) code. Renal colic was diagnosed andtreated by emergency medicine physicians. Average temperature and humidity values according to months were acquiredfrom the Republic of Turkey Ministry of Forestry and Water Affairs General Directorate of Meteorology.Results: This study was conducted with a total number of 5661 cases between the ages of 2 and 91. 3344 (59.1%) of thepatients were male, and 2317 (40.9%) were female. The average examination age of the cases was 41.58±14.63. There was astatistically significant difference between the seasons in terms of the examination ages of the cases (p=0.001). As a result ofthe dual comparisons, the average examination age of the cases in the summer season was found to be lower at a statistically significant level than the averages of the cases in Winter (p=0.001), Spring (p=0.001) and Fall (p=0.045) seasons (p<0.05).Discussion and Conclusion: In our study, we detected that meteorological parameters have an effect on renal colic development, and this effect varies according to the age and gender of the patient. Especially in the warmer months, malepatients are more sensitive towards dehydration than female patients, probably due to the hormonal mechanisms, so therenal colic incidence is higher in these patients. Thus, the suggestion is to increase fluid intake and not to stay dehydrated.